腸病毒潛伏期為二到十天，平均約三到五天。腸病毒可以引起多種疾病，但有五至八成的患者是沒有臨床症狀或臨床症狀極為輕微，而大部分病例過了幾天之後就會自然痊癒的，這些不顯性感染以成人較為常見
。
感染腸病毒時，患者會出現的最典型症狀為口腔、手掌、腳掌出現水泡、潰瘍，可能合併發燒；此外還有泡疹性咽峽炎(herpangina)、無菌性腦膜炎、病毒性腦炎、肢體麻痺症候群、急性出血性結膜炎、心肌炎等都可能是罹患腸病毒所出現的臨床症狀。
腸病毒臨床上可以引起多種疾病，其中很多是無症狀，有些則只有發燒或類似一般感冒症狀，但有些則會出現特殊的臨床表現，如手足口病(hand-foot-mouth disease)、泡疹性咽峽炎(herpangina)、無菌性腦膜炎、病毒性腦炎、肢體麻痺症候群、急性出血性結膜炎(acute hemorrhagic conjunctivitis)、嬰兒急性心肌炎及成人心包膜炎、流行性肌肋痛、急性淋巴結性咽炎(acute lymphonodular pharyngitis)、發燒合併皮疹(febrile illness with rash)等。
(一) 腸病毒感染較常見的疾病、臨床症狀及可能病毒型別如下：
1.泡疹性咽峽炎：
由A族克沙奇病毒引起。特徵為突發性發燒、嘔吐及咽峽部出現小水泡或潰瘍，病程為4至6天。病例多數輕微無併發症，少數併發無菌性腦膜炎。
2.手足口病：
由A族克沙奇病毒及腸病毒71型引起，特徵為發燒及身體出現小水泡，主要分布於口腔黏膜及舌頭，其次為軟顎、牙齦和嘴唇，四肢則是手掌及腳掌、手指及腳趾。常因口腔潰瘍而無法進食，病程為7～10天。
3.嬰兒急性心肌炎及成人心包膜炎：
由B族克沙奇病毒引起，特徵為突發性呼吸困難、蒼白、發紺、嘔吐。開始可能誤以為肺炎，接著會又明顯心跳過速，快速演變成心衰竭、休克、甚至死亡，存活孩子會復原得很快。
4.流行性肌肋痛：
由B族克沙奇病毒引起，特徵為胸部突發陣發性疼痛且持續數分鐘到數小時，合併發燒、頭痛及短暫噁心、嘔吐和腹瀉，病程約1週。
5.急性淋巴結性咽炎：
由A族克沙奇病毒引起。特徵為發燒、頭痛、喉嚨痛、懸雍垂和後咽壁有明顯白色病灶，持續4至14天。
6.發燒合併皮疹：
與各類型克沙奇及伊科病毒都有關，皮疹通常為斑丘疹狀，有些會出現小水泡。
《表列》
| 常見疾病 | 臨床症狀 | 可能病毒型別 |
| 泡疹性咽峽炎 | 突發性發燒、厭食、嘔吐，咽峽部出現小水泡或潰瘍；病程四到六天；多數輕微無併發症，少數併發無菌性腦膜炎。 | 克沙奇A1-A10、A16、A22型病毒、腸病毒71型 |
| 手足口病 | 發燒、手腳、口腔及臀部周圍出現稍微隆起的紅疹，其頂端大多有小水泡，主要分布於口腔黏膜及舌頭，其次為軟顎、牙齦和嘴唇，四肢則見於手掌、腳掌、手指及腳趾間；病程七到十天，常因口腔潰瘍而無法進食，有些需要住院給予點滴。 | 克沙奇A16、A4、A5、A9、A10、B2、B5型病毒，腸病毒71型 |
| 流行性肌肋痛 | 胸部突發性陣痛，持續數分鐘至數小時，合併發燒、頭痛、短暫噁心、嘔吐及腹瀉；病程約七天。 | 克沙奇B族病毒 |
| 嬰兒急性心肌炎及成人心包膜炎 | 發燒、突發性呼吸困難、蒼白、發紺、嘔吐，開始可能誤以為肺炎，接著會有明顯心跳過速，快速演變成心衰竭、休克，甚至死亡，存活的孩子會復原的很快。 | 克沙奇B族病毒 |
| 急性淋巴結性咽炎 | 發燒、頭痛、喉嚨痛，懸雍垂和後咽壁有白色明顯病灶；病程約四至十四天。 | 克沙奇A10病毒 |
| 無菌性腦膜炎及腦炎 | 發燒、噁心、嘔吐、頭痛、頸部僵硬、煩躁、睡眠不安穩。 | 克沙奇病毒、小兒麻痺病毒、伊科病毒、腸病毒71型 |
| 發燒合併皮疹 | 發燒、皮疹，通常為斑丘疹狀，有些會出現小水泡。 | 克沙奇病毒及伊科病毒 |
| 急性出血性結膜炎 | 眼睛發紅出血、有異物或疼痛感、畏光、眼皮腫脹、分泌物增加，通常一眼先發炎，數小時內擴散到另一眼；病程約十天。 | 腸病毒70型及克沙奇 |
(二) 致病因子(Infectious agent)
腸病毒屬於小RNA病毒科(Picornaviridae)，為一群病毒的總稱，在1997年以前已知而被分類的腸病毒共有小兒麻痺病毒(Poliovirus)共3型(1至3型)、克沙奇病毒(Coxsackievirus)，含23種A型(A1至A22型，A24型)及6種B型(B1-B6型)、伊科病毒(Echovirus)共30型(1至33型，但8、10及28型除外)及腸病毒(Enterovirus)(68型～)等60餘型，近年來又陸續發現多種型別，依據基因序列分析結果將之重新歸類，分為人類腸病毒A、B、C、D(Human enterovirus A、B、C、D)型，其中腸病毒71型被歸類於人類腸病毒A型。
在所有腸病毒中，除了小兒麻痺病毒之外，以腸病毒71型(Enterovirus Type 71)最容易引起神經系統的併發症，此病毒是在1969年美國加州的一次流行中首次被分離出來，當時引起很多無菌性腦膜炎與腦炎的病例。此後包括澳洲、日本、瑞典、保加利亞、匈牙利、法國、香港、馬來西亞等地都有流行的報告，台灣在十幾年前也曾經流行過，可見此型腸病毒的分布是全世界性的。
比較特別的是，雖然世界各地的報告大多發現，感染腸病毒71型後，發生神經系統併發症的比率特別高，但是嚴重程度各有不同，有的只出現腦膜炎、輕微腦炎、肢體麻痺等非致命性的併發症，有的則像1998年台灣的流行一樣出現死亡病例，包括保加利亞、匈牙利、馬來西亞、日本都有過類似的情形，其可能的危險因子尚待進一步的探討與研究。
(三) 發生情形(Occurrence)
腸病毒適合在濕、熱的環境下生存與傳播，臺灣地處亞熱帶，全年都有感染個案發生，所以腸病毒感染症儼然已是台灣地區地方性的流行疾病之一。依據臺灣地區歷年監測資料顯示，幼童為感染併發重症及死亡之高危險群體，重症致死率約在3.8%至25.7%之間。引起腸病毒感染併發重症之型別以腸病毒71型為主
，克沙奇病毒居次；一般腸病毒感染主要常見症狀為手足口病或泡疹性咽峽炎。
由全國五百餘個定點醫師監視系統資料顯示，腸病毒疫情每年約自3月下旬開始上升，於5月底至6月中達到高峰後，即緩慢降低，而後於9月份開學後再度出現一波流行。以年齡層分析，患者以5歲以下幼童居多，約佔所有重症病例90%；在死亡病例方面，以5歲以下幼童最多。
(四) 傳染方式(Mode of transmission)
人類是腸病毒唯一的傳染來源，主要經由腸胃道(糞便、水或食物污染)或呼吸道(飛沫、咳嗽或打噴嚏)傳染，亦可經由接觸病人皮膚水泡的液體而受到感染。在發病前數天，喉嚨部位與糞便就可發現病毒，此時即有傳染力，通常以發病後一週內傳染力最強；而患者可持續經由腸道釋出病毒，時間長達8到12週之久
。
(五) 潛伏期(Incubation period)
腸病毒潛伏期為2到10天，平均約3到5天。腸病毒可以引起多種疾病，其中多數感染者(約50%至80%)沒有症狀，有些則只有發燒或類似一般感冒的症狀，少數會出現一些特殊的症狀，包括手足口病、泡疹性咽峽炎、無菌性腦膜炎、病毒性腦炎、肢體麻痺症候群、急性出血性結膜炎、心肌炎等。
資料來源 疾病管制局
http://www.cdc.gov.tw/sp.asp?xdurl=disease/disease_content.asp&id=1662&mp=1&ctnode=1498
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